Enterprise GitHub や Private レポジトリを使っている場合はアクセストークンを使って、レポジトリをクローンしたりする必要があります。
Personal access tokens を既に持っている場合は、下記のように https を使って、URL の中に token を書くことで Git アクセスできるようになります。
HTTPS で access token を使う
git clone https://<token>@<repo_url>/<org>/<repo_name>.gitaccess token の取得方法
右上の自分のアカウントクリックすると、プルダウンメニューが表示されるので、Settings を選択します。
次に Developer settings をクリック。
左のメニューから Personal access tokens をクリックし、右側に表示される Generate new token をクリック。
トークンの名前を入力して、スコープにチェックを入れます。トークンを使ってレポジトリの情報を取りたいということであれば、上記のように repo/read:org で大体事は足りるのではないかと思います。
下の方にある Generate token をクリックします。
上記赤枠のところにアクセストークンが生成されるのでメモしておきます。忘れると再生成するしかないので、ご注意ください。